美国生物遗传学各大牛人

生物专业|2014年05月04日 16:33
生物遗传学

  我是从C.D.Allis,Danny Reinberg,Tony Kouzarides,Yi Zhang, Yang Shi这几个人发的文章看起的,这几个人基本上就是目前做表观遗传最牛的一批人了。然后你看看他们文章citation里面出现频率比较高的人名,那往往就是大牛了,然后一点一点扩展。个人感觉看CNS及其子刊还是王道。另外推荐一个很好的网站,http://www.epidna.com/ 可以查这个领域最top的lab,也可以查该领域最新的论文。

  然后在申请选校的过程中,我也逐渐了解到一些epigenetics领域的big names和rising stars。所以我感觉看各个牛校的faculty也是了解一个领域的好学校好lab的方法。我的做法是每看一个学校,就把相关领域做 epigenetics的faculty留下来,然后以后看CNS时或者Journal club上看到熟悉的名字,就重点关注下。

  我所了解的:

  C.D.Allis在Rockfeller,Yang Shi在Harvard Medical School,目前做表观遗传最牛的一批人差不多都在这两家了。另外Danny Reinberg在NYU;Yi Zhang在UNC,都是很好的学校。你可以在各个学校网站了解下,不过如果你打算申请的话,除了UNC,别的建议也不要抱太大期望,看看就行了。。。

  另外一些选校时了解到的faculty:

  Rick Young @MIT

  Bradley Bernstein @Harvard

  Kathrin Plath @UCLA

  以上三位都是研究胚胎干细胞pluripotency、细胞核reprogramming的表观遗传机制。

  Andrew Feinberg @JHU,

  Randy Jirtle @Duke,

  都是做DNA甲基化和基因组印记的,epigenomics的先锋。前者 建立了一套genome-wide epigenetic analysis的方法,用来发现新的疾病相关的imprinted gene;后者研究母体怀孕期间的nutrition摄入与子代患cancer,behavioral disorders,schizophrenia的风险的联系。Histone dynamics in embryogenesis,epigenomics

  Bruce Stillman @CSHL,Stillman应该是DNA replication和nucleosome assembly方面最权威的科学家了吧。

  Howard Cedar @Hebrew University, 研究aberrant DNA methylation in carcinogenesis and development和Replication Timing,感觉很学究气的一个老头。

  Lin-feng Chen@UIUC,做Histone modifying enzyme与NF-kB subunit的相互作用以及NF-kB的各种翻译后修饰对NF-kB信号通路的调控。

  David Shechter @Einstein,C.D.Allis的学生,09年刚评上的AP,年轻有为,以爪蟾为模型,研究配子形成、胚胎早期发育过程中的histone variant的dynamics。

  做植物的我不太了解,只能谈谈我申过的学校的印象:

  Scott Michaels & Craig Pkkard @IUB,前者研究春化作用的表观遗传机制;后者研究植物种间杂交中的核仁显性现象,都是各自领域的大牛,据说MCDB的中国学生都去他们那rotation。

  Stowers:

  Ali Shilatifard 在H3K4me领域做了很多奠基性的工作,发现了酵母中的H3K4甲基化酶复合物COMPASS,另外一个主要贡献是发现了白血病发病过程中,MLL fusion protein对Hox gene的misregulation。研究的模型很广,从酵母到果蝇到哺乳动物都有,但我看其实也都是细胞水平,还没有做到个体水平。

  这里纠正一下,很多人以为Ali是老印,由于担心老印的人品不好而不敢去套,后来才知道他其实是伊朗人,而且人品应该还好。

  Ronald Conaway&Joan Canaway 研究糖基化和泛素化修饰的,刚刚发了篇cell,发现OGT的蛋白水解酶活性。

  Jerry Workman研究组蛋白乙酰化和H3K36甲基化在转录延伸中作用。

  MD Anderson:

  一直听说是做cancer research和免疫很牛的地方。个人感觉他家的epigentics也做得比较好。有自己的center for cancer epigenetics,里面一大批研究prostate cancer, breast cancer, Leukemia的faculty,里面有一个武大的校友Dr.Xiaobing Shi,研究PHD finger以及非组蛋白的甲基化修饰。

  Mayo:

  Zhi-guo Zhang,研究H3K56ac对nucleosome assembly的调控和DNA damage repair,貌似是Bruce Stillman实验室出来的,发了很多cell的牛文。

  另外介绍一下一个武大的校友裴华东,今年刚刚发了一篇nature,也是做DNA damage repair的。据说mayo是全美仅次于Johns Hopkins的医院,cancer research 取材会非常方便,开发出来的新的cancer therapy可以很方便地应用于临床,里面很多研究DNA damage repair,breast cancer,prostate cancer的,发的文章也都是CNS级的。

  UMMS:

  RNA牛人云集的地方:Craig Mello,Phillip Zamore,Victor Ambryos。。。听学长介绍,做表观遗传的主要有两个牛人,一个是oliver rando,他是用大规模测序来做histone dynamics的先锋,建立了一整套相关的技术;还有一个是job dekker,他是第一个建立chromosome 3-D structure分析技术的人,独一无二。两个人都是年轻有为的,很快都有很好的publication,并且能树立起一个学术地位的。Oliver Rando去年12月刚发了一篇cell,主要是用老鼠模型发现了paternal diet 能够影响子代的基因表达。我觉得在高等动物中由environment和nutrition改变所造成的表观遗传现象也会是今后表观遗传研究的一个热门话题。

  另外,好多牛校由于自己没定位到那个层次去,如Harvard, MIT, Yale, JHU,Stanford, Caltech, Rockfeller, UCSD,UCSF,UCLA,Upenn,Scripps,Salk,MSKCC,Wistar。。。就没介绍了。

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